编辑推荐
《药物研究中的蛋白质组学》可供生物化学、分子生物学、蛋白质组学、免疫学、功能基因组学等牛命科学相关领域的研究院所、高校教师、研究生和科研人员参考使用。
作者简介
作者：（美国）M.哈马驰（Hamacher M.） 译者：周兴茹 裴端卿
目录
译者序
序
前言
第一篇简介
1优化蛋白质组网络管理，促进药物开发
1.1引言
1.2管理的任务和目标
1.3网络
1.4生物标记物的评估
1.5药物开发中蛋白质组网络的建设
1.6管理网络的实现：脑蛋白质组计划
1.6.1国立基因组研究网络：人脑蛋白质组计划
1.6.2人类蛋白质组组织：国际脑蛋白质组计划
2蛋白质组数据的标准化、存储和交换
2.1引言
2.2蛋白质分析工具
2.2.1UniProt
2.2.2InterPro
2.2.3Proteome Analysis Database
2.2.4International Protein Index
2.2.5Reactome
2.3数据的存储和提取
2.4蛋白质组学标准化预案
2.5通用蛋白质组学标准（GPS）
2.6质谱分析
2.7分子间的相互作用
2.8总结
第二篇蛋白质组技术
3差异凝胶电泳（DIGE）：临床研究的新一代二维凝胶电泳
3.1引言
3.2差异凝胶电泳（新一代蛋白质2—DE检测技术）
3.2.1DIGE CyDye最小量荧光标记的应用（CyDye最小量荧光的最小量标记）
3.2.2DIGE CyDye饱和量荧光标记的应用
3.2.3DIGE蛋白质组分析中统计学的应用
4生物质谱：基础研究及药物研发相关技术
4.1引言
4.2电离理论
4.2.1基质辅助激光解吸电离（MALDI）
4.2.2电极喷射电离
4.3质谱设备介绍
4.4蛋白质鉴定方法
4.5用于比较和功能蛋白质组学的定量质谱
4.6代谢标记法
4.6.115N标记
4.6.2细胞培养中含有稳定同位素的氨基酸标记（SILAC）
4.7化学标记法
4.7.1蛋白质水平的化学法同位素标记
4.7.2肽段水平的稳定同位素标记
4.8定量MS：解密蛋白质蛋白质相互作用
4.9总结
5蛋白质组学中的多维液相柱色谱——我们身在何处？
5.1引言
5.2为何需要MD—LC／MS？
5.3MD—LC／MS方法的基本内容
5.3.1概述
5.3.2需要考虑的问题
5.3.3样品的纯化
5.3.4MD—LC的多相系统选择
5.3.5操作部分
5.3.6尖端技术——含酶解技术
5.4MD—LC在蛋白质组学中的应用——现状简介
5.5样品的纯化：克服蛋白质组学分析“瓶颈”的方法
5.6总结
6多肽组学技术及其在药物研究中的应用
6.1引言
6.2药物研究中的肽
6.2.1肽的研究历史
6.2.2多肽的简易生化特性
6.2.3多肽药物
6.2.4多肽生物标记物
6.2.5临床多肽组学
6.3多肽组学技术的发展
6.3.1多肽分析方法进展
6.3.2多肽组学概论
6.3.3对内源性多肽的Top—Down鉴定
6.4差异多肽组学的应用
6.4.1药物开发中的多肽组学
6.4.2多肽组学在体内实验中的应用
6.5展望
7蛋白质生物芯片在蛋白质组学中的应用
7.1引言
7.2技术概况
7.2.1蛋白质的固定和表面化学
7.2.2蛋白质的转印和检测
7.2.3芯片内含物
7.3蛋白质芯片的应用
7.4对药物研究和开发的贡献
8体外鉴定蛋白质相互作用的研究进展
8.1引言
8.2cAMP—依赖性蛋白激酶模型系统
8.3用SPR生物传感器实时监控相互作用
8.4药物设计中的ITC
8.5高通量筛选工具——荧光极化
8.6Alpha筛选在药物筛选上的应用
8.7总结
9完整细胞和组织中的分子网络——生物学和药物开发中的机遇
9.1引言
9.2一个关于细胞的比喻
9.3分子调控网络图：理论基础
9.4设想会骑车的机器人
9.5以分子网络模块标准化为几何目标
9.6获取功能信息：展望药物研发
第三篇应用
10从靶标到先导化合物
10.1引言
10.2材料和方法
10.2.1细胞和培养条件
10.2.2体外活性检测
10.2.3亲和色谱
10.2.4电泳和蛋白质鉴定
10.2.5BIAcore分析
10.2.6酰基氰化物的合成
10.3结果
10.4讨论
11药物研究中的差异磷酸化蛋白质组分析法
11.1引言
11.2人类血小板的磷酸化蛋白质组学
11.2.1皮层肌动蛋白
11.2.2调节性肌球蛋白轻链
11.2.3蛋白质二硫键异构酶
11.3鉴定人体血小板中cAMP—和cGMP—依赖性蛋白质激酶的底物
11.4分析野生型和基因敲除型小鼠的磷酸化蛋白质组差异，鉴定抗炎治疗的新型治疗靶点
11.5总结
12血清学与蛋白质组学技术在肾细胞癌生物标记物开发中的应用
12.1引言
12.1.1肾细胞癌
12.2开发生物标记物的方法
12.3采用不同蛋白质组学技术鉴定生物标记物的优点
12.4生物标记物的类型
12.5肾细胞癌细胞系和活组织切片的蛋白质组分析
12.6鉴定有差异表达的蛋白质
12.7总结
13细胞器蛋白质组学在抗药性研究中的应用
13.1引言
13.1.1临床问题及蛋白质组学对策
13.2实验目的和实验设计
13.2.1细胞系
13.2.2细胞器分离
13.2.3蛋白质组分分离和鉴定
13.2.4蛋白质丰度的定量比较
13.3二羟蒽二酮耐受型MCF—7细胞中膜蛋白质和核蛋白质的变化
14人体体液的临床神经蛋白质组学：痴呆早期和鉴别诊断中的脑脊液和血液分析
14.1引言
14.2阿尔茨海默症的神经化学标记物
14.2.1β—淀粉样蛋白质前体（β—APP）：代谢和对AD诊断的影响
14.2.2Tau蛋白质及其磷酸化形式
14.2.3ApoE的基因型
14.2.4其他可能的因子
14.2.5CSF参数的综合分析
14.2.6展望：寻找生物标记物的新技术——质谱（MS）、二维荧光差异凝胶电泳（DIGE）及多路技术（multiplexing）
14.3总结
15蛋白质组学在阿尔茨海默症中的应用
15.1引言
15.2蛋白质组学分析
15.2.1样品制备
15.2.2二维电泳
15.2.3蛋白质定量
15.2.4基质辅助激光解吸／电离飞行时间质谱
15.3在AD中发生表达下调和修饰的蛋白质
15.3.1突触蛋白
15.3.2导向蛋白
15.3.3信号传导蛋白质
15.3.4氧化蛋白
15.3.5热激蛋白
10.3.6在淀粉样斑中富集的蛋白质
15.4不足之处
16心脏蛋白质组学
16.1心脏蛋白质组学
16.1.1心脏2—D蛋白质数据库
16.1.2扩张型心肌病
16.1.3心脏病的动物模型
16.1.4心脏亚蛋白质组学
16.1.5人工培养心肌细胞的蛋白质组学
16.1.6心脏疾病和移植后心脏抗原的蛋白质组学特性
16.1.7急性移植排斥反应的标记物
16.2血管蛋白质组
16.2.1血管的蛋白质组学
16.2.2血管细胞的蛋白质组学
16.2.3激光捕获显微分离（LCM）
16.3总结
……
第四篇市场
索引
文摘
版权页：
插图：
细胞培养系统是蛋白质组研究中研究人为刺激对蛋白质表达细微变化影响的一种理想方法。因为，在细胞培养系统中，尤其是在确定的细胞系中，它能够提供样品间极为微量变化的检测系统。但是，细胞培养中为了维持细胞在体外的存活会使它们的基因型发生改变，导致蛋白质表达有所不同，所以细胞体外培养所得的结果和在体内有所不同。这种变化过程在从组织分离的第一代细胞中迅速发生，更有可能对这些细胞产生长久影响，尤其是利用这种变化可以建立永久培养的细胞系。培养心肌细胞具有更大的挑战性，因为尽管新生的心肌细胞能够在体外存活并生长，但完全分化的成体心肌细胞只能在体外短期培养，没有细胞分化能力。
目前，用分离的心肌细胞进行蛋白质组研究的报道还很少。在一项新生小鼠心肌细胞研究中，研究者用2—D方法研究儿茶酚胺对蛋白质合成的影响（He et al.，1992a，b）。他们发现，在用去甲肾上腺素进行处理时，蛋白质表达发生了显著变化（Heet al.，1992a）。用α—肾上腺素受体阻断剂——Prazosin处理后，可以清楚地区分α和非α（或许是β）肾上腺素受体介导的儿茶酚胺在蛋白质表达中的作用（He et al.，1992b）。遗憾的是，在进行这项研究的时候还没有鉴定蛋白质的方法。
《药物研究中的蛋白质组学》可供生物化学、分子生物学、蛋白质组学、免疫学、功能基因组学等牛命科学相关领域的研究院所、高校教师、研究生和科研人员参考使用。
作者简介
作者：（美国）M.哈马驰（Hamacher M.） 译者：周兴茹 裴端卿
目录
译者序
序
前言
第一篇简介
1优化蛋白质组网络管理，促进药物开发
1.1引言
1.2管理的任务和目标
1.3网络
1.4生物标记物的评估
1.5药物开发中蛋白质组网络的建设
1.6管理网络的实现：脑蛋白质组计划
1.6.1国立基因组研究网络：人脑蛋白质组计划
1.6.2人类蛋白质组组织：国际脑蛋白质组计划
2蛋白质组数据的标准化、存储和交换
2.1引言
2.2蛋白质分析工具
2.2.1UniProt
2.2.2InterPro
2.2.3Proteome Analysis Database
2.2.4International Protein Index
2.2.5Reactome
2.3数据的存储和提取
2.4蛋白质组学标准化预案
2.5通用蛋白质组学标准（GPS）
2.6质谱分析
2.7分子间的相互作用
2.8总结
第二篇蛋白质组技术
3差异凝胶电泳（DIGE）：临床研究的新一代二维凝胶电泳
3.1引言
3.2差异凝胶电泳（新一代蛋白质2—DE检测技术）
3.2.1DIGE CyDye最小量荧光标记的应用（CyDye最小量荧光的最小量标记）
3.2.2DIGE CyDye饱和量荧光标记的应用
3.2.3DIGE蛋白质组分析中统计学的应用
4生物质谱：基础研究及药物研发相关技术
4.1引言
4.2电离理论
4.2.1基质辅助激光解吸电离（MALDI）
4.2.2电极喷射电离
4.3质谱设备介绍
4.4蛋白质鉴定方法
4.5用于比较和功能蛋白质组学的定量质谱
4.6代谢标记法
4.6.115N标记
4.6.2细胞培养中含有稳定同位素的氨基酸标记（SILAC）
4.7化学标记法
4.7.1蛋白质水平的化学法同位素标记
4.7.2肽段水平的稳定同位素标记
4.8定量MS：解密蛋白质蛋白质相互作用
4.9总结
5蛋白质组学中的多维液相柱色谱——我们身在何处？
5.1引言
5.2为何需要MD—LC／MS？
5.3MD—LC／MS方法的基本内容
5.3.1概述
5.3.2需要考虑的问题
5.3.3样品的纯化
5.3.4MD—LC的多相系统选择
5.3.5操作部分
5.3.6尖端技术——含酶解技术
5.4MD—LC在蛋白质组学中的应用——现状简介
5.5样品的纯化：克服蛋白质组学分析“瓶颈”的方法
5.6总结
6多肽组学技术及其在药物研究中的应用
6.1引言
6.2药物研究中的肽
6.2.1肽的研究历史
6.2.2多肽的简易生化特性
6.2.3多肽药物
6.2.4多肽生物标记物
6.2.5临床多肽组学
6.3多肽组学技术的发展
6.3.1多肽分析方法进展
6.3.2多肽组学概论
6.3.3对内源性多肽的Top—Down鉴定
6.4差异多肽组学的应用
6.4.1药物开发中的多肽组学
6.4.2多肽组学在体内实验中的应用
6.5展望
7蛋白质生物芯片在蛋白质组学中的应用
7.1引言
7.2技术概况
7.2.1蛋白质的固定和表面化学
7.2.2蛋白质的转印和检测
7.2.3芯片内含物
7.3蛋白质芯片的应用
7.4对药物研究和开发的贡献
8体外鉴定蛋白质相互作用的研究进展
8.1引言
8.2cAMP—依赖性蛋白激酶模型系统
8.3用SPR生物传感器实时监控相互作用
8.4药物设计中的ITC
8.5高通量筛选工具——荧光极化
8.6Alpha筛选在药物筛选上的应用
8.7总结
9完整细胞和组织中的分子网络——生物学和药物开发中的机遇
9.1引言
9.2一个关于细胞的比喻
9.3分子调控网络图：理论基础
9.4设想会骑车的机器人
9.5以分子网络模块标准化为几何目标
9.6获取功能信息：展望药物研发
第三篇应用
10从靶标到先导化合物
10.1引言
10.2材料和方法
10.2.1细胞和培养条件
10.2.2体外活性检测
10.2.3亲和色谱
10.2.4电泳和蛋白质鉴定
10.2.5BIAcore分析
10.2.6酰基氰化物的合成
10.3结果
10.4讨论
11药物研究中的差异磷酸化蛋白质组分析法
11.1引言
11.2人类血小板的磷酸化蛋白质组学
11.2.1皮层肌动蛋白
11.2.2调节性肌球蛋白轻链
11.2.3蛋白质二硫键异构酶
11.3鉴定人体血小板中cAMP—和cGMP—依赖性蛋白质激酶的底物
11.4分析野生型和基因敲除型小鼠的磷酸化蛋白质组差异，鉴定抗炎治疗的新型治疗靶点
11.5总结
12血清学与蛋白质组学技术在肾细胞癌生物标记物开发中的应用
12.1引言
12.1.1肾细胞癌
12.2开发生物标记物的方法
12.3采用不同蛋白质组学技术鉴定生物标记物的优点
12.4生物标记物的类型
12.5肾细胞癌细胞系和活组织切片的蛋白质组分析
12.6鉴定有差异表达的蛋白质
12.7总结
13细胞器蛋白质组学在抗药性研究中的应用
13.1引言
13.1.1临床问题及蛋白质组学对策
13.2实验目的和实验设计
13.2.1细胞系
13.2.2细胞器分离
13.2.3蛋白质组分分离和鉴定
13.2.4蛋白质丰度的定量比较
13.3二羟蒽二酮耐受型MCF—7细胞中膜蛋白质和核蛋白质的变化
14人体体液的临床神经蛋白质组学：痴呆早期和鉴别诊断中的脑脊液和血液分析
14.1引言
14.2阿尔茨海默症的神经化学标记物
14.2.1β—淀粉样蛋白质前体（β—APP）：代谢和对AD诊断的影响
14.2.2Tau蛋白质及其磷酸化形式
14.2.3ApoE的基因型
14.2.4其他可能的因子
14.2.5CSF参数的综合分析
14.2.6展望：寻找生物标记物的新技术——质谱（MS）、二维荧光差异凝胶电泳（DIGE）及多路技术（multiplexing）
14.3总结
15蛋白质组学在阿尔茨海默症中的应用
15.1引言
15.2蛋白质组学分析
15.2.1样品制备
15.2.2二维电泳
15.2.3蛋白质定量
15.2.4基质辅助激光解吸／电离飞行时间质谱
15.3在AD中发生表达下调和修饰的蛋白质
15.3.1突触蛋白
15.3.2导向蛋白
15.3.3信号传导蛋白质
15.3.4氧化蛋白
15.3.5热激蛋白
10.3.6在淀粉样斑中富集的蛋白质
15.4不足之处
16心脏蛋白质组学
16.1心脏蛋白质组学
16.1.1心脏2—D蛋白质数据库
16.1.2扩张型心肌病
16.1.3心脏病的动物模型
16.1.4心脏亚蛋白质组学
16.1.5人工培养心肌细胞的蛋白质组学
16.1.6心脏疾病和移植后心脏抗原的蛋白质组学特性
16.1.7急性移植排斥反应的标记物
16.2血管蛋白质组
16.2.1血管的蛋白质组学
16.2.2血管细胞的蛋白质组学
16.2.3激光捕获显微分离（LCM）
16.3总结
……
第四篇市场
索引
文摘
版权页：
插图：
细胞培养系统是蛋白质组研究中研究人为刺激对蛋白质表达细微变化影响的一种理想方法。因为，在细胞培养系统中，尤其是在确定的细胞系中，它能够提供样品间极为微量变化的检测系统。但是，细胞培养中为了维持细胞在体外的存活会使它们的基因型发生改变，导致蛋白质表达有所不同，所以细胞体外培养所得的结果和在体内有所不同。这种变化过程在从组织分离的第一代细胞中迅速发生，更有可能对这些细胞产生长久影响，尤其是利用这种变化可以建立永久培养的细胞系。培养心肌细胞具有更大的挑战性，因为尽管新生的心肌细胞能够在体外存活并生长，但完全分化的成体心肌细胞只能在体外短期培养，没有细胞分化能力。
目前，用分离的心肌细胞进行蛋白质组研究的报道还很少。在一项新生小鼠心肌细胞研究中，研究者用2—D方法研究儿茶酚胺对蛋白质合成的影响（He et al.，1992a，b）。他们发现，在用去甲肾上腺素进行处理时，蛋白质表达发生了显著变化（Heet al.，1992a）。用α—肾上腺素受体阻断剂——Prazosin处理后，可以清楚地区分α和非α（或许是β）肾上腺素受体介导的儿茶酚胺在蛋白质表达中的作用（He et al.，1992b）。遗憾的是，在进行这项研究的时候还没有鉴定蛋白质的方法。
| ISBN | 9787030205629 |
|---|---|
| 出版社 | 科学出版社 |
| 作者 | M.哈马驰 (Hamacher M.) |
| 尺寸 | 16 |